市二院胸外科创建于1980年，全今已有30年历史，是连云港最早建立的专科之一，也是苏北鲁南地区开展胸外科手术时间最早、数量最多的医院。

目前食管、贲门良恶、性病变的手术治疗是该院胸外科优势之一：常规开展食管道癌、贲门癌根治术，年手术100余例，手术切除率、术后生存率居省内领先水平；对复杂食管、贲门癌的根治术具有丰富的临床经验，能熟练开展食管癌超胸顶部吻合、颈部吻合，结肠代食管、等高难度手术；食管平滑肌瘤、食管憩室、贲门失迟缓症、食管裂孔疝等良性病变的手术治疗，效果良好。

另外，该科对食管、贲门癌术后吻合口瘘、食管穿孔等死亡率高的并发症和难治性疾病，采取置管内引流技术，治愈率高，大大降低了术后死亡率。