中医科创建于1956年，是市级一类临床重点专科，2013年被省卫生厅、省中医药局确定为江苏省综合（专科）医院示范中医科建设单位。目前拥有中医内科、针灸科、理疗科、中医肿瘤科4个专科，分东、西两个院区。其中东院区针灸科善于运用古九针结合脉法针灸，将传统针灸学与软组织外科学理论相结合，治疗颈腰椎关节等急慢性疼痛，以及经络损伤相关疾病，如难治性头痛、眩晕、胃脘痛、心律失常、失眠、盆腔炎、乳腺增生、月经失调、子宫肌瘤等。中医肿瘤科运用中医药治疗各种肿瘤，提高生活质量，延长生命，减轻疼痛，对放、化疗患者具有减毒增敏、提升免疫力、减轻骨髓抑制等作用。西院区中医内科以辨证与辨病相结合，采用中医为主，中西医结合治疗，配合现代化的检查手段，治疗肝胆病、脾胃病、肾病及妇科病等，尤其是对慢性肾炎、慢性肾衰进行个体化治疗，对降血肌酐、消蛋白具有明显的治疗效果。